Caractérisation Phénotypique Et Moléculaire De La Lignée H Du Virus De La Fièvre De La Vallée Du Rift Au Sénégal En 2022

La Fièvre de la Vallée du Rift (FVR) est une zoonose réémergent transmise par des moustiques, avec un impact significatif sur la santé publique et vétérinaire. En Afrique de l’Ouest, son profil épidémiologique varie d’un pays à l’autre. Cinq lignées principales du virus de la FVR (A, C, G, K, et N) ont été précedemment détectées, mais depuis 2020, la lignée H provenant  d’Afrique du Sud a été la principale cause des épidémies dans ces régions.

Des échantillons cliniques collectés au Sénégal via le système national de surveillance ont été testés par RT-PCR et ELISA IgM pour une infection aiguë par le virus FVR (VFVR). Des analyses moléculaires et phénotypiques ont été réalisées sur des échantillons positifs, comparant la lignée H avec d’autres lignées épidémiques (G et C).

Quatre cas humains de FVR ont été détectés au Sénégal et l’analyse phylogénétique a montré que ces souches appartenaient à la lignée H. Les tests in vitro ont révélé des différences d’efficacité de réplication entre les lignées, tandis que les études génétiques ont mis en évidence des mutations non conservatrices, plus communes à la lignée G ou spécifiques à la lignée H.

Nos résultats ont montré la réémergence de la lignée H au Sénégal en 2022, sa haute efficacité de réplication virale in vitro, et soutiennent l'idée que la diversité génétique affecte la réplication virale. Cette étude montre l’importance de la surveillance génomique dans la lutte contre les arboviroses et apporte de nouvelles perspectives sur les propriétés biologiques de la lignée H.